Xã Ninh Vân nằm ở phía tây nam huyện Hoa Lư, có vị trí địa lý:

• Phía bắc giáp các xã Ninh Hải, Ninh Thắng
• Phía đông giáp Ninh An và huyện Yên Mô
• Phía tây và phía nam giáp thành phố Tam Điệp.

Xã Ninh Vân có diện tích là 12,63 km², dân số là 9.173 người[1], mật độ dân số 726 người/km².

Trụ sở xã cách trung tâm thành phố Ninh Bình 7,5 km. Xã này có một phần diện tích thuộc quần thể di sản thế giới Tràng An.

Đây là một trong 10 đơn vị hành chính cấp xã có dân số đông đúc nhất Ninh Bình, theo thứ tự gồm: Khánh Nhạc, Trường Yên, Lai Thành, Yên Nhân, Phát Diệm, Khánh Trung, phường Thanh Bình, Kim Mỹ, Quang Thiện, Ninh Vân.